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P. falciparum malaria-infected red blood cells

Groupe d'étude sur l'interprétation des données de PCE

Development of statistical methods to infer the relationship between the percentage of resistant infections, parasite clearance half-life and the proportion of treated individuals still positive on days one, two and three of treatment

Logique

La résistance à l'artémisinine est actuellement caractérisée par une clairance prolongée des parasites asexués du sang dans les premiers jours du traitement. Sans un marqueur moléculaire validé, il est actuellement impossible de déterminer si une infection individuelle est résistante ou sensible. Nous émettons l'hypothèse que la vitesse à laquelle les parasites sont éliminés, selon les estimations de l'outil Parasite Clearance Estimator (Évaluateur de la clairance parasitaire) du réseau WWARN, est liée à la probabilité de résistance de l'infection et qu'il s'agit là d'un caractère héréditaire.  Nous allons développer un modèle de simulation statistique pour définir la relation qui existe entre le pourcentage sous-jacent d'infections résistantes le plus probable, la proportion de personnes traitées demeurant positives après un, deux et trois jours de traitement et la distribution de la demi-vie de la clairance au cours de l'émergence, de la propagation et des phases de fixation de la résistance à l'artémisinine, dans une population d'individus infectés par P. falciparum.  Ces analyses devraient permettre d'estimer, au moment de l'échantillonnage, le niveau de la résistance dans cette population et d'avertir rapidement de l'existence de faibles niveaux de résistance à l'artémisinine.

Objectifs

  • Fournir un outil d'évaluation du pourcentage sous-jacent d'infections résistantes le plus probable, dans des endroits où les demi-vies de clairance parasitaire ont été estimées 
  • Fournir un outil pour classer les endroits où seules les données quotidiennes sont disponibles, afin d'estimer la probabilité de la présence d'une résistance et ainsi guider la sélection des sites d'études pharmacocinétiques et pharmacodynamiques ou d'études cliniques ou moléculaires plus détaillées 
  • Fournir une carte de probabilité de la résistance, élaborée à partir des résultats du modèle

Critères d’inclusion

  • Estimations des demi-vies de la clairance individuelle pour tous les ensembles de données analysés par l'outil Parasite Clearance Estimator
  • Ensembles de données contenant des mesures quotidiennes de la parasitémie
  • Pour tous les ensembles de données, y compris ceux mentionnés ci-dessus : tous les échantillons avec les informations suivantes
    • Taille de l'échantillon de l'étude
    • Répartition de la parasitémie initiale pour chaque patient
    • Heure du traitement et heure de chaque prélèvement destiné aux mesures de la parasitémie
    • Pourcentage de patients demeurant parasitémiques aux jours 1, 2 et 3
    • Âge du patient
    • Médicaments reçus dans le cadre du traitement, y compris, le cas échéant, le fabricant
    • Indication de surveillance des doses de médicaments et de la chronologie

Données minimales requises

  • Numérations parasitaires en série avec date et heure du traitement, et des mesures parasitaires, jusqu'à clairance complète ; une parasitémie négative doit être notée zéro ; ou mesures quotidiennes de parasitémie
  • Lieu et caractéristiques de l'étude ; détails du traitement et détails de la méthode de comptage des parasites et des mesures d'assurance qualité

Normalisation et analyse des données

Il n'y a pas de limite au nombre de fichiers de données qui peut être téléchargé, ni du type de format. Avant le téléchargement des données, les membres du groupe d'étude doivent s'inscrire sur le site Web de WWARN et ouvrir une session en cliquant sur le lien Données de contribution, en haut de chaque page Web. Les contributeurs doivent accepter les conditions de soumission avant de télécharger les données. Pour plus d'informations sur le partage des données avec WWARN et sur la façon dont WWARN utilisera les données, visitez le site Web WWARN. WWARN normalisera les données téléchargées selon les critères définis par WWARN. Les ensembles de données vont être regroupés au sein d'une seule base de données individuelles patient de qualité. 

Gouvernance du groupe d’étude

Le groupe d'étude comprend des chercheurs qui ont contribué à l'analyse groupée en fournissant des jeux de données pertinents. Les jeux de données restent la propriété du chercheur. Le groupe d'étude décide collectivement d'ajouter des études supplémentaires, des analyses de données et des plans de publication, en accord avec la politique de publication WWARN. Le groupe d'étude nomme une ou deux personnes pour coordonner les activités, notamment l'analyse des données et la rédaction des publications qui seront ensuite examinées par le groupe. Il est proposé que le Dr Lisa White dirige le groupe d'étude par interim.

Proposed analyses

  • Un plan complet d'analyses statistiques sera élaboré et approuvé par le groupe d'étude. Il devra inclure :
  • des modèles de mélange à effets mixtes pour explorer la nature de la distribution des demi-vies de la clairance, par année et par lieu ; cette méthode permettre de déduire :
    • une distribution des demi-vies associée aux infections résistantes ; 
    • une distribution des demi-vies associée aux infections sensibles ;
  • un modèle de simulation stochastique pour explorer la relation entre le pourcentage de patients qui sont positifs au parasite, le premier, deuxième ou troisième jour, la distribution de la parasitémie à l'admission, la taille de l'échantillon et le pourcentage des infections résistantes à l'artémisinine ;
  • un ajustement des analyses ci-dessus, le cas échéant, afin de tenir compte de l'utilisation de médicaments associés, de marqueurs moléculaires et d'autres facteurs.

Chronologie

La collecte de données sera ouverte aux nouveaux participants jusqu'à la fin de décembre 2014. Le plan et les résultats analytiques seront mis à la disposition de tous les participants qui pourront les commenter et les approuver avant leur publication.