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Alignement of DNA sequences

Groupe d’étude sur les marqueurs moléculaires AS-AQ/AL

Étudier le rôle des marqueurs moléculaires candidats de la résistance à la luméfantrine et à l’amodiaquine dans les résultats cliniques des ACT

Logique

L’efficacité des combinaisons thérapeutiques à base d’artémisinine (ACT) est lourdement influencée par l’efficacité du médicament complémentaire. Les marqueurs moléculaires candidats dans les gènes pfcrt et pfmdr1 du P falciparum sont considérés comme impliqués dans la résistance à l’amodiaquine et à la luméfantrine. Toutefois, les taux d’échec des combinaisons artésunate-amodiaquine (AS-AQ) et artéméther-luméfantrine sont plutôt faibles, ce qui entrave les efforts de validation des marqueurs de résistance candidats. Par ailleurs, l’effet des halotypes de résistance sur les résultats cliniques semble varier selon la zone géographique. 

Objectifs

  • Établir si les polymorphismes des gènes pfcrt et pfmdr1 jouent un rôle dans la résistance cliniquement pertinente

Critères d’inclusion

  • Études sur le P falciparum ;
  • Études sur l’efficacité clinique de l’artéméther-luméfantrine et/ou l’artésunate-amodiaquine avec un suivi de 28 jours minimum ; et,
  • Données moléculaires définissant les haplotypes pfcrt 72-76 et/ou les polymorphismes pfmdr1 (mutations de points et variation du nombre de copies) chez les parasites isolés des patients au jour 0. Les données moléculaires du jour de la parasitémie récurrente sont souhaitables mais pas obligatoires.

Standardisation et analyse des données

Après le téléchargement dans la base de données du réseau WWARN, WWARN standardisera les ensembles de données en fonction des plans de gestion et d’analyse statistique des données des groupes Clinique et Moléculaire WWARN et les regroupera dans une base unique de données individuelles de qualité sur les patients. 

Les analyses (selon l’approbation du groupe d’étude) peuvent inclure : 

  • Test de l’association entre polymorphismes de résistance au jour 0 et phénotype clinique (risque cumulatif de recrudescence ajustée mesuré par l’analyse de survie et les résultats de traitement classés par l’OMS) ; et
  • Test de sélection post-traitement des marqueurs de résistance en comparant la prévalence des polymorphismes au jour 0 à la prévalence au jour de la parasitémie récurrente.

Gouvernance du groupe d’étude

Le groupe d’étude est constitué de chercheurs volontaires qui apportent des ensembles de données pertinents à l’analyse regroupée. Les ensembles de données restent la propriété du chercheur. Le groupe d’étude prend des décisions collectives concernant l’ajout d’autres études, l’analyse des données et les plans de publications, conformément à la politique de publication de WWARN. Le groupe d’étude nommera une ou deux personnes pour coordonner les activités comme l’analyse des données et l’ébauche de publications et de rapports à réviser par le groupe. Il a été proposé que le Dr Meera Venkatesan dirige le groupe d’étude par intérim.

Chronologie

Des détails sur la participation au groupe d’étude ont été tout d’abord publiés en octobre 2011. Les groupes d’étude connus pour disposer d’ensembles de données pertinents ont été contactés en octobre et novembre 2011. Une réunion entre les éventuels participants au groupe d’étude s’est tenue lors de la réunion annuelle de l’ASTMH en décembre 2011 pour discuter de la politique de gouvernance et de publication du groupe d’étude.

L'étude a été publieé dans American Journal of Tropical Medicine en juillet 2014:

Venkatesan M, Gadalla NB, Stepniewska K, Dahal P, Nsanzabana C, Moriera C, Price RN, Mårtensson A, Rosenthal PJ, Dorsey G, Sutherland CJ, Guérin P, Davis TM, Ménard D, Adam I, Ademowo G, Arze C, Baliraine FN, Berens-Riha N, Björkman A, Borrmann S, Checchi F, Desai M, Dhorda M, Djimdé AA, El-Sayed BB, Eshetu T, Eyase F, Falade C, Faucher JF, Fröberg G, Grivoyannis A, Hamour S, Houzé S, Johnson J, Kamugisha E, Kariuki S, Kiechel JR, Kironde F, Kofoed PE, LeBras J, Malmberg M, Mwai L, Ngasala B, Nosten F, Nsobya SL, Nzila A, Oguike M, Otienoburu SD, Ogutu B, Ouédraogo JB, Piola P, Rombo L, Schramm B, Somé AF, Thwing J, Ursing J, Wong RP, Zeynudin A, Zongo I, Plowe CV, Sibley CH. Polymorphisms in Plasmodium falciparum Chloroquine Resistance Transporter and Multidrug Resistance 1 Genes: Parasite Risk Factors that Affect Treatment Outcomes for P. falciparum Malaria after Artemether-Lumefantrine and Artesunate-Amodiaquine Am J Trop Med Hyg. 2014 Oct;91(4):833-43. doi:10.4269/ajtmh.14-0031