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Molecular Surveyor dhfr-dhps Méthodologie

Afrique

  • Données fournies par Inbarani Naidoo et Cally Roper de la London School of Hygiene and Tropical Medicine
  • Recherches bibliographiques effectuées sur Pubmed, African Journal Online et Bioline
  • Les termes recherchés étaient « malaria » et « dhfr » ou « dhps » ou « 540 » ou « 437 » ou « 436 » ou « 581 » ou « 51 » ou « 59 » ou « 108 » ou « 164 » 
  • Les études devaient comprendre une analyse des gènes dhfr ou dhps dans les isolats de P falciparum prélevés chez des personnes infectées vivant dans une ou plusieurs zones géographiques clairement définies en Afrique
  • Le résumé et le texte intégral des études pertinentes ont été analysés et la prévalence des séquences de type sauvage et mutantes a été relevée
  • Les recherches ont été effectuées d’octobre 2005 à janvier 2011

Asie

  • Données fournies par Mallika Imwong et l’équipe de la faculté de médecine tropicale de l’université Mahidol
  • Recherches bibliographiques effectuées sur Pubmed
  • Les termes recherchés étaient « falciparum » et « Asia » et « dhfr » ou « dhps »
  • Les études devaient comprendre une analyse des gènes dhfr ou dhps dans les isolats de P falciparum prélevés chez des personnes infectées vivant dans une ou plusieurs zones géographiques clairement définies en Asie
  • Le résumé et le texte intégral des études pertinentes ont été analysés et la prévalence des séquences de type sauvage et mutantes a été relevée sur un total de 33 études
  • Les recherches ont été effectuées en mars 2010

Amérique latine

  • Données fournies par Vladimir Corredor, faculté de médecine, Universidad Nacional de Colombia
  • Recherches bibliographiques effectuées sur Pubmed, SciELO, Bioonline et Biblioteca Virtual de Salud
  • Les termes recherchés étaient « malaria drug resistance » ou « dhfr falciparum » ou « dhps falciparum » et « South America » ou « [nom en anglais de chacun des pays composant l’Amérique du Sud] »
  • Le résumé et le texte intégral des études pertinentes ont été analysés et la prévalence des séquences de type sauvage et mutantes a été relevée sur un total de 24 études
  • Les recherches ont été effectuées en 2009 et actualisées en février 2011

Lieux et années

  • Les lieux et les années d’étude reposent sur des informations fournies dans les publications ou communiquées par les auteurs 
  • Un «  lieu approximatif » est employé quand il n’a pas été possible de trouver le nom précis du centre ou lorsque la publication a associé des échantillons provenant de plusieurs centres 
  • Les années de prélèvement des échantillons qui ont été estimées par les auteurs de l’étude sont indiquées comme telles
  • Lorsqu’il n’a pas été possible de trouver l’année de prélèvement des échantillons pour une étude, elle a été estimée à 3 ans avant l’année de publication de l’étude.