La découverte de marqueurs moléculaires de résistance dans le gène Kelch 13 donne l'occasion inhabituelle de surveiller presque en temps réel l'apparition et la propagation de la résistance. L'évaluation de la prévalence de ces marqueurs moléculaires dans d'autres régions peut constituer un système d'avertissement précoce pour déclencher des réponses rapides et développer des stratégies de contrôle.
L'outil Artemisinin Molecular Surveyor est une carte interactive qui résume la prévalence de ces marqueurs moléculaires, dans la région en hélice (à « propeller ») du gène Kelch 13 du parasite paludique, en fonction du lieu et de l'année. Il fournit ainsi une représentation claire et normalisée des données probantes accumulées jusqu'à présent permettant d'orienter les principales stratégies de surveillance mises en place aux niveaux international, régional et national.
L'outil Artemisinin Molecular Surveyor
- affiche la distribution des marqueurs de résistance trouvés sur le gène Kelch 13 du parasite paludique Plasmodium falciparum en fonction de leur lien avec une clairance parasitaire retardée :
- les mutations K13 associées à une clairance parasitaire lente (associées à une clairance lente cochée),
- toutes les mutations K13 non synonymes (associées à une clairance lente non cochée),
- affiche les données de plus de 66 280 échantillons issues de 208 études publiées et couvrant des sites répartis dans 71 pays ;
- présente les analyses moléculaires des génotypes K13 ;
- est doté de réglages par défauts flexibles qui peuvent être facilement changés par l'utilisateur ;
- permet de visualiser les pays avec les données sur la barre de gauche ;
- propose, sous la carte, d'autres visualisations des mêmes données qui permettent d'explorer l'évolution dans le temps et de comparer deux sites d'intérêt différents de manière plus approfondie.
Les punaises de la carte sont colorées en fonction de la prévalence des mutations associées à une clairance parasitaire retardée :
- Un site où aucun isolat présentant des mutations dans la région en hélice (>440) – associées à une clairance retardée – n'a été observé, est de couleur verte.
- Un site comportant >0 - <5 % d'isolats présentant une mutation associée à une clairance retardée dans la région en hélice (>440) est de couleur jaune.
- Un site où sont observées des mutations dans la région en hélice (>440) associées à une clairance retardée avec une prévalence combinée de ≥5 % - <10 % est de couleur ambre.
- Un site où sont observées des mutations dans la région en hélice (>440) associées à une clairance retardée avec une prévalence combinée ≥10 % est de couleur rouge.
Une partie de ces données provient des cartes de risque du paludisme de l'OMS. Vous avez le droit non exclusif, mondial et libre de redevances d'utiliser, de reproduire, d'extraire, de télécharger, de copier, de distribuer, d'afficher ou d'inclure les ensembles de données et données qui y sont contenues dans d'autres produits à des fins de santé publique.
Pour découvrir plus d'informations sur l'outil ou pour savoir comment fournir des données, merci d'envoyer un courrier électronique à wwarn [at] wwarn [dot] org(link sends e-mail)
Pour en savoir plus ou pour optimiser vos outils de signalement des résistances à l'artémisinine, consultez notre outil sur les marqueurs kelch qui préconise certains critères minimaux lors de l'établissement de rapports sur les marqueurs du gène kelch13 (pfkelch13) de Plasmodium falciparum.
- Découvrez les méthodes utilisées par l'outil Artemisinin Molecular Surveyor.
Référence
Observatoire des données sur les maladies infectieuses (Infectious Diseases Data Observatory [IDDO]) (2015) : Artemesinin Molecular Surveyor Observatoire des données sur les maladies infectieuses (Ressource interactive). https://www.wwarn.org/tracking-resistance/artemisinin-molecular-surveyor