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Groupe Scientifique Moléculaire

Notre groupe Moléculaire fournit des outils qui résument l’étendue géographique et temporelle des marqueurs moléculaires de la résistance à l'artémisinine, la chloroquine, la luméfantrine, l'amodiaquine et à la sulfadoxine-pyriméthamine. Ces informations sont affichées sous forme des cartes pour faciliter la gestion et la contrainte de la résistance aux antipaludiques.

Les objectifs du groupe

  • Traduire des données sur la prévalence des marqueurs moléculaires de résistance en outils de suivi robustes qui représentent l'étendue de la résistance aux antipaludiques actuellement utilisés, contrôlent leur propagation et orientent les efforts de confinement

  • Faciliter le partage des procédures de génotypage et des données sur les marqueurs moléculaires avec les phénotypes cliniques et in vitro correspondants issues des régions de résistance émergente 
  • Fournir un service d'analyse et de normalisation des données aux contributeurs. Le téléchargement, la transformation et l'analyse automatisés des données sont décrits dans le Plan de gestion et d'analyse statistique des données moléculaires

  • Coordonner les analyses groupées qui corrèlent les génotypes du parasite avec les données cliniques rétrospectives pour découvrir des tendances subtiles ou des effets de sous-population en constituant des groupes d'étude

Encourager la collecte de données de qualité

  • Les procédures : méthodes détaillées sur la collecte d'échantillons, la préparation d'ADN et le génotypage des parasites pour détecter la résistance
  • L’évaluation externe de qualité des analyses moléculaires : collaboration avec les laboratoires pour confirmer leur capacité à exécuter les analyses moléculaires et pour éliminer les sources de divergences des resultats afin d’assurer la qualité de leurs résultats
  • Les outils moléculaires : outils disponibles gratuitement,  sur le site de l'université du Maryland, offerts par le Pr Chris Plowe et le Center for Vaccine Development.

Combler les lacunes de la recherche

  • Molecular Surveyors : cartes interactives qui résument la date, la localisation géographique du site d'étude et la prévalence des marqueurs moléculaires de résistance à  :
    • la chloroquine, l'amodiaquine et à la luméfantrine présents sur les gènes pfcrt et pfmdr1 de Plasmodium falciparum, compilées à partir de données publiées et non-publiées 
    • la sulfadoxine-pyriméthamine présents sur les gènes dhfr et dhps de Plasmodium falciparum, compilées à partir de données publiées
    • l'artémisinine présents en particulier sur le gène Kelch 13 de Plasmodium falciparum et compilés à partir de données publiées et non-publiées

Pour plus d’informations sur les moyens de soumettre des données au centre de données WWARN, de rejoindre ou de créer un groupe d'étude, veuillez contacter molecular [at] wwarn [dot] org

Soumettre des données moléculaires à WWARN

  • Pour concilier les différences de conception de l’étude, nous avons besoin de données au niveau du patient et de données d’échantillons
  • Les données peuvent provenir des essais d’efficacité moléculaire ou des tests moléculaires. Voir la case pour les variables de données moléculaires requises et les données supplémentaires, mais non obligatoires.
  • Le service de chargement en ligne et sûr de WWARN accepte tout type de format 
  • Pour plus d’aide sur la préparation ou le chargement des fichiers, veuillez envoyer un courriel à molecular [at] wwarn [dot] org 

Variables de données moléculaires

Requises pour chaque base de données soumise :

  • Identifiant de patient ou d’échantillon unique (rendu anonyme)
  • Date de collecte des échantillons
  • Génotype(s) des marqueurs de résistance moléculaire
  • Informations de base sur le site et la conception de l’étude

Facultatif pour chaque base de données soumise :

  • Âge du patient (priorité élevée, si disponible)
  • Microsatellites génotypés dans les régions présentant des marqueurs de résistance
  • Complexité ou multiplicité de l’infection