Pour surmonter les différences entre les protocoles des études soumises au reseau WWARN, celles ci doivent porter individuellement sur les patients et les échantillons de sang. Les données moléculaires peuvent provenir d’essais d’efficacité clinique ou d’études moléculaires. Les échantillons peuvent avoir été obtenus de nombreuses façons, notamment par piqûre au doigt, prélèvement de sang veineux ou isolats in vitro provenant de patients infectés, et repas de sang de moustiques.
Des mesures de sécurité strictes garantissent que les fichiers de données individuelles ne seront accessibles qu’à leur contributeur d’origine, sauf si ce dernier choisit de partager ses données avec des tiers à travers notre système sécurisé. Pour plus d’informations sur le traitement des données apportées, voir la section Contribution de données.
Parmi les variables requises avec chaque contribution de données moléculaires, citons :
- Identifiant de l’échantillon ou du patient (rendu anonyme) et date d’inclusion dans l’étude
- Date de prélèvement de l’échantillon
- Génotype(s) des marqueurs moléculaires de résistance, notamment polymorphismes de nucléotide simple, répétitions de longueur variable et polymorphismes du nombre de copies
- Les génotypes manquants pour tous les marqueurs moléculaires de résistance doivent être signalés comme « Non génotypé » ou « Échec du génotypage »
- Les génotypes des polymorphismes de nucléotide simple peuvent être partagés sous la forme de nucléotides simples ou d’acides aminés ou comme chaînes
- Renseignements sur le centre d’étude et le protocole de l’étude
Parmi les autres variables utiles, mais NON obligatoires, citons :
- Âge du patient (priorité élevée, si disponible)
- Microsatellites génotypés dans les régions bordant les marqueurs de résistance
- Complexité ou multiplicité de l’infection
Si les données moléculaires sont obtenues des patients participant à un essai d’efficacité clinique, dont les données sont également partagées avec le réseau WWARN, veuillez inclure les variables requises répertoriées à la page Données cliniques.
Nous continuons à travailler à l’élaboration de formats de saisie de données,des recommandations de conception d’étude et de recueil de données. Visualisez le plan de gestion et d’analyse statistique des données (DMSAP, de l'anglais Data Management and Statistical Analytical Plan) du module Moléculaire pour obtenir une description claire et transparente des méthodes utilisées par le réseau WWARN pour traiter et analyser les données moléculaires.
