Chef du module Informatique
Pédiatre consultant honoraire, hôpital John Radcliffe, Oxford, Royaume-Uni
Professeur de pédiatrie tropicale et Professeur de recherche clinique au Medical Research Council (MRC), Oxford University, Royaume-Uni
Chef du programme sur le paludisme, Wellcome Trust Sanger Institute
Directeur, MRC Centre for Genomics and Global Health, Oxford University et Wellcome Trust Sanger Institute
Associé surnuméraire, St. John’s College, Oxford, Royaume-Uni
Le professeur Dominic Kwiatkowski est un pédiatre dont les travaux portent sur les maladies infantiles dans les pays en voie de développement. Il a accompli sa formation doctorale en Afrique de l’Ouest avant d’entrer à l’Université d’Oxford en 1989. Depuis 1998, il est professeur de recherche clinique au Medical Research Council (MRC). Il dirige le groupe international de santé infantile au service de pédiatrie de l’université et le groupe d’étude des infections infantiles au Wellcome Trust Centre for Human Genetics. Le professeur Dominic Kwiatkowski est nommé conjointement investigateur principal au Wellcome Trust Sanger Institute à proximité de Cambridge. Le principal sujet de recherche du groupe est le paludisme. Ses membres s’efforcent de comprendre les mécanismes biologiques fondamentaux de la maladie et de l’immunité en unissant les forces complémentaires de l’Institut Sanger et de l’Université d’Oxford, ce qui leur permet d’associer de nouvelles technologies d’étude du génome et des méthodes statistiques à des études cliniques et épidémiologiques à grande échelle. L’une de leurs principales tâches est de coordonner MalariaGEN, un réseau de chercheurs répartis dans 20 pays dont l’objectif est d’accélérer la mise au point d’un vaccin antipaludique en découvrant les mécanismes naturels de l’immunité protectrice. Son équipe possède une expérience considérable dans l’utilisation de différents outils, notamment informatiques, pour soutenir le développement de réseaux multicentriques de partage de données à grande échelle.
Formation
1979 Licence de médecine et licence de chirurgie, Guy’s Hospital, London University, Royaume-Uni
1974 Licence ès lettres (physiologie, psychologie et philosophie), Oxford University, Royaume-Uni
Affiliations professionnelles
Membre, Royal College of Physicians, Londres, Royaume-Uni
Associé, Royal College of Physicians, Londres
Associé , Royal College of Paediatrics and Child Health, Royaume-Uni
Associé , Academy of Medical Sciences, Royaume-Uni<
Publications représentatives
Clark TG, Campino SG, Anastasi E, Auburn S, Teo YY, Small K, Rockett KA, Kwiatkowski DP, Holmes CC. A Baysian approach using covariance of SNP data to detect differences in linkage disequilibrium patterns between groups of individuals. Bioinformatics, Jun 16.
Teo YY, Small K, Kwiatkowski DP. Challenges of genome-wide association analysis in Africa. Nature Review Genetics, 2010 Feb;11(2):149-60, article de synthèse.
Almagro-Garcia J, Manske M, Carret C. Campino S, Auburn S, MacInnis BL, Maslen G, Pain A, Newbold CI, Kwiatkowski DP, Clark TG. SnoopCGH: software for visualising comparative genomic hybridization data. Bioinformatics, 2009 Oct 15; 25(20):2732-3.
Clark TG, Fry AE, Auburn S, Campino S, Diakite M, Green A, Richardson A, Teo YY, Small K, Wilson J, Jallow M, Sisay-Joof F, Pinder M, Sabeti P, Kwiatkowski DP, Rockett KA. Allelic heterogeneity of G6PD deficiency in West Africa and severe malaria susceptibility. Eur J Hum Genet. 2009 Feb 18.
Jallow M, Teo YY, Small KS, Rockett KA, Deloukas P, Clark TG, Kivinen K, Bojang KA, Conway DJ, Pinder M, Sirugo G, Sisay-Joof F, Usen S, Auburn S, Bumpstead SJ, Campino S, Coffey A, Dunham A, Fry AE, Green A, Gwilliam R, Hunt SE, Inouye M, Jeffreys AE, Mendy A, Palotie A, Potter S, Ragoussis J, Rogers J, Rowlands K, Somaskantharajah E, Whittaker P, Widden C, Donnelly P, Howie B, Marchini J, Morris A, Sanjoaquin M, Achidi EA, Agbenyega T, Allen A, Amodu O, Corran P, Djimde A, Dolo A, Doumbo OK, Drakeley C, Dunstan S, Evans J, Farrar J, Fernando D, Hien TT, Horstmann RD, Ibrahim M, Karunaweera N, Kokwaro G, Koram KA, Lemnge M, Makani J, Marsh K, Michon P, Modiano D, Molyneux ME, Mueller I, Parker M, Peshu N, Plowe CV, Puijalon O, Reeder J, Reyburn H, Riley EM, Sakuntabhai A, Singhasivanon P, Sirima S, Tall A, Taylor TE, Thera M, Troye-Blomberg M, Williams TN, Wilson M, Kwiatkowski DP; Wellcome Trust Case Control Consortium; Malaria Genomic Epidemiology Network. Genome-wide and fine-resolution association analysis of malaria in West Africa. Nat Genet. 2009 May 24.
Mangano VD, Clark TG, Auburn S, Campino S, Diakite M, Fry AE, Green A,Richardson A, Jallow M, Sisay-Joof F, Pinder M, Griffiths MJ, Newton C, Peshu N, Parker, M, Bull, SJ, de Vries, J, Agbenyega, T, Doumbo, OK, Kwiatkowski, DP. Ethical data release in genome-wide association studies in developing countries. PLoS Med. 2009;11:e1000143.
Manske, HM, Kwiatkowski, DP. LookSeq: a browser-based viewer for deep sequencing data. Genome Res. 2009 Nov;19(11):2125-32.
Manske HM, Kwiatkowski DP. SNP-o-matic. Bioinformatics 2009 Sep 15;25(18):2434-5.
Malaria Genomic Epidemiology Network. A global network for investigating the genomic epidemiology of malaria. Nature. 2008 Dec 11;456(7223):732-7.